陳章甫畢業於廣東陸軍速成學堂第一期步兵科，後進入保定軍校第一期砲兵科、日本陸軍士官學校第二期步兵科就讀。1914年，陳章甫回到廣東，於肇慶講武堂任教，在護國戰爭期間響應討伐龍濟光，並加入粵軍魏邦平部擔任統領。1920年，陳章甫升任粵軍第三軍第五旅旅長，後又升任師長兼梧州警備司令。魏邦平失勢後，陳章甫所部遭到滇桂軍繳械，本人轉至黃埔軍校任職。
北伐開始後，陳章甫出任國民革命軍第四軍第十三師第三十七團團長，後升任副師長、第三師師長、第二十五師師長等，負責留守廣東南部地區，後轉入李濟深一系。李濟深遭到中央軟禁後，陳章甫逐漸淡出第一線，轉任軍事參議院參議，後返鄉辦學。陳章甫於1936年授為中將；1937年3月時在家鄉病逝。