馬全良出身貧農，1918年時投軍，後被選至馬鴻逵所辦的綏遠軍官學校學習，畢業後在馬鴻逵部擔任基層軍官，1927年時已升任團長。北伐結束後，馬全良升任旅長，在中原大戰時隨馬鴻逵支持中央，後返回寧夏，任保安處長，並參加阻擊長征共軍的戰役。1936年，馬全良晉升少將；抗戰開始後出任第一六八師獨立旅長，後任第十一軍獨立第十旅旅長、第一六八師師長、第十一軍副軍長等。戰後，馬全良在國共內戰期間曾任整編第十八師副師長、寧青聯合兵團副指揮、賀蘭軍軍長、寧夏兵團司令等，但於1949年底在銀川兵敗投共。中共建政後，馬全良曾任甘肅省畜牧廳長、水利廳長等，於1965年8月6日逝世。