盛彤笙於1928年考入中央大學生物系，1931年時轉至醫學院，畢業後赴德國留學，於1936年取得柏林大學（Humboldt-Universität zu Berlin）醫學博士學位，兩年後再取得獸醫學博士學位。盛彤笙於1939年歸國，後於西北農學院、中央大學執教，戰後出任國立獸醫學院院長。盛彤笙於1949年後留在中國，後仍任西北畜牧獸醫學院院長，兼任西北行政委員會委員、財經委員會委員，於1955年時獲選為中國科學院學部委員。
盛彤笙在反右、文革期間皆遭到波及，但並未中斷其研究；文革落幕後調至江蘇農業科學院任職。1987年5月9日，盛彤笙病逝於南京。著有《獸醫微生物學實驗指導》，譯有《獸醫細菌學》等。