許琨早就讀北洋陸軍速成學堂法文班，後升入陸軍大學正則班第四期，1916年畢業後曾在曹錕所辦之漕河軍官教育團擔任教官。1917年，許琨隨張懷芝、張宗昌部開赴湖南參加護法戰爭，失敗後與張宗昌投奔奉系，歷任吉林省防軍第三混成旅團長、奉軍第三旅第十四團團長、第二十九旅旅長等。第二次直奉戰爭期間，許琨隨張宗昌部南下，攻入山東、江蘇、安徽；1926年時一度代理安徽軍務督辦，並被授為拱威將軍。
直魯聯軍成立後，許琨就任第七軍軍長，後兼任前敵副總司令、第四路總司令等，一度進逼南京，但此後連戰皆潰。1928年6月，直魯聯軍殘部在灤東遭到繳械，許琨隨張宗昌逃往大連，此後生平便無記載。