葛敬恩出身商販家庭,於1904年考入浙江武備學堂,畢業後擔任陸軍小學堂教官、督練公所科員等,曾加入光復會及同盟會。辛亥革命期間,葛敬恩參加浙江新軍的起事,又參加南京之役,並被任命為兵站交通部長、南北議和隨員。民國成立後,葛敬恩進入陸軍大學正則班第四期就讀,畢業後赴日本陸軍大學深造,於1921年畢業。葛敬恩畢業返國後於浙軍任職,1924年時升任浙軍第一師參謀長(師長陳儀)。北伐期間,葛敬恩隨陳儀響應國民革命軍,並調任第十九軍副軍長、總司令部參謀處長等。
北伐結束後,葛敬恩出任編遣委員會總務部副主任、主任;1930年時出任青島市長,在中原大戰後歷任參謀次長、軍委會第一廳副廳長、軍委會航空署長等。1934年,葛敬恩調任浙江省政府委員,但因貪汙而去職,後閒居上海。抗戰期間,葛敬恩曾加入汪兆銘政府,但在抗戰後期又回到國民政府。戰後,葛敬恩隨陳儀赴臺灣,就任行政長官公署秘書長,但在任期間官聲不佳,二二八事件後被調回大陸,任立法委員。國共內戰後期,葛敬恩於1949年投共,晚年加入中國國民黨革命委員會(民革)。1979年10月10日,葛敬恩在上海病逝。