1920年3月，蕭友梅回到北京。他以其淵博的學識和早年的革命經歷及同國內政界高層人士的關係，要謀得一個薪位高的職務並不困難；但是他決定實現自己的理想，毅然選擇了開創音樂教育事業的艱苦道路。當時，音樂專業並不受重視，在高等學校裡不過是附庸，有的與美術合在一起稱為圖音系，有的與體育合在一起稱為音體系，有的更是大雜燴稱為圖工操練。

9月，蕭友梅擔任中華民國教育部編審員，並與楊仲子共同創辦了北京女子高等師範學校（北師大前身）音樂體育專修科兼任附設實驗小學主任。時任北京大學校長的蔡元培很器重蕭友梅的為人和才能，蕭友梅也很贊同蔡元培‘以美育代宗教’的主張。

1921年，蕭友梅應邀擔任了北京大學中國文學系音樂講師兼該校‘音樂研究會’導師；蕭友梅聲譽日隆，吸引了許多學生來學習音樂。

1922年，經蕭友梅提議，‘音樂研究會’正式改建為‘北京大學附設音樂傳習所’（簡稱：北大傳習所），並擔任此該所教務主任。他還建立了我國第一個管弦樂隊並親任指揮；這個樂隊的前身是清末民初海關稅務局的管弦樂隊，一共只有17個人。樂隊雖小，但從1922年底到1927年將近5年的時間，卻開過40餘次音樂會，演奏了海頓、莫札特、貝多芬、舒伯特等音樂大師的作品，為北京群眾介紹了不少西方音樂藝術知識。

1926年，蕭友梅兼任北京國立藝術專門學校的音樂系主任，他十分重視由師生共同參與的、定期的音樂會，這些活動不僅大大豐富了當時北京的社會音樂活動，而且對中國新音樂文化的發展也具有深遠的影響。

1927年6月，北洋軍閥的教育部以‘有傷社會風化’、‘浪費國家錢財’為由，下令停辦北京所有國立院校的音樂系科。蕭友梅苦心經營了5年的北大音樂傳習所也被迫解散，他憤而辭職，隨蔡元培南下去尋求發展。

1927年10月1日，蔡元培就任南京政府大學院（後改為教育部）院長，經他力爭，政府終於通過了蕭友梅提出的關於創辦國立音樂院的計劃。蕭友梅作為‘音樂院籌備員’提出了一個按招生人數分年遞加經費的5年計畫，每年招生50名，需經常費每月3000元，至於所需的60000元開辦費及校舍建築費，財政部僅許以‘於戰爭結束後即籌畫撥給’的空頭支票。頭一個月的經常費，還是蕭友梅在孫文大總統府時的同事楊銓為之力爭來的；10月24日收到此款，蕭友梅遵從楊銓‘趕快籌備‘的囑咐，就用這3000元權充開辦費，在上海創辦了中國第一所正規的專業高等音樂學府——國立音樂院，並立即開始公開招生。蕭友梅最初任教務主任，主持日常行政工作，同年12月被任命為代理院長，1928年9月被正式任命為院長。

後來成為著名音樂家的丁善德就是在1928年以自學的一點琵琶知識從昆山前來報考的，蕭友梅慧眼識英才，將其招入學校悉心培養；1928年冼星海由北平來上海考入國立音樂學院，因家貧無以為繼，蕭為他安排了文字抄寫工作以半工半讀。其實，早在1926年蕭友梅任國立北平藝術專門學校音樂系主任時，就曾為當時在該校就讀的貧苦學生冼星海安排抄譜或做圖書管理員，得些收入來補助生活。

1929年6月，學生因宿雜費問題和校方發生衝突而罷課，並激發了學潮。蕭友梅因此事向教育部提出辭職，國立音樂院宣告停辦，蕭友梅積勞咯血去莫干山養病。適逢南京政府修正‘大學組織法’，規定僅傳授一種專門技術的學校都改為專科學校，蕭友梅為此於7月致函同盟會摯友、時任立法院長的胡漢民說明國內外的情況，希望仍單獨設立音樂院。7月26日，南京政府公佈了‘專科學校組織法’，國立音樂學院也於此時更改為國立音樂專科學校，蕭友梅的意見未被採納。

8月19日，教育部長蔣夢麟聘請蕭友梅擔任國立音樂專科學校校長，原音樂院的學生需憑音專的通知重新註冊；然而，冼星海、熊樂枕、蔣鳳之、陳振鐸等12名學潮中為首的學生僅收到一張‘學分成績單’，被取消了入學資格，令蕭友梅非常痛心。

不久，蕭友梅把國立音樂院改名為‘上海國立音樂專科學校’，擔任校長直到病逝。他將當時在上海甚至全國各地能夠找得到的著名中外音樂家，或高薪聘請或苦言相勸，網羅在自己的麾下；就連國文、英文等共同課，他也是請水準最高的人來教，如易韋齋、龍榆生（時為暨南大學國文系主任）曾任這所學校國文課的教師。

1929年，世界著名鋼琴家、俄羅斯的查哈羅夫旅居上海，為請其任教於國立音專，蕭友梅多次登門拜訪，並將月薪提至400元（普通教授為200元）；實踐證明，查哈羅夫從那時起直至1942年病逝於上海，對中國鋼琴教學水準的提高發揮了重要作用。

1930年秋，蕭友梅聘請留美回國的著名音樂家黃自任教務主任，此後，二人攜手為中國剛剛起步的專業音樂教育作出了巨大的貢獻。

蕭友梅按照自己的理想盡力推進中國的現代專業音樂教育，經過數年堅持不懈的努力，終於使國立音專成為具有相當規模和國際水準的中國最高音樂學府，為中國培養出不少優秀的音樂人才，這些人才中的大多數後來成為推動中國音樂事業發展的骨幹力量。

另外，蕭友梅憑藉自己淵博的學識和藝術才華，親自設立‘舊樂研’課程（即中國古代音樂史），並自行編撰了一大批音樂教材、論著，一生創作多種體裁的音樂作品。

1940年12月31日，蕭友梅因為肺病在上海去世，由‘音專’集資將其安葬在萬國公墓。

歷史影響：

蕭友梅是中國近現代歷史上最早掌握西方作曲手法，並進行創作的作曲家之一。他一生作了100多首歌曲：《今樂初集》、《新樂初集》等，尚有鋼琴曲、管弦樂曲、大提琴、絃樂四重奏、合唱曲等。他是中國現代音樂史上開基創業的一代宗師、現代專業音樂教育的開拓者與奠基者，為中國音樂文化的建設與發展，做出了不可磨滅的歷史性貢獻，在中國近代音樂史上享有崇高的地位。

同時，蕭友梅畢生做育英才，除了冼星海、丁善德、賀綠汀、喻宜萱之外，著名中國作曲家音樂教育家林聲翕也曾跟從他學習和聲。

（資料來源，參考：維基百科、人民網、百度百科）