程德全少時在家讀書，後為廪貢生，於1890年赴北京入國子監學習，次年入黑龍江副都統文全部下擔任幕僚，不久又調往安徽任知縣。1899年，程德全回到黑龍江將軍壽山麾下任幕僚，壽山在八國聯軍時自殺，程德全則被派往俄軍駐地談判，但遭扣押而無結果。1903年，程德全升任道員、署理齊齊哈爾副都統，後又署理黑龍江將軍、巡撫及奉天巡撫。
1910年，程德全調為江蘇巡撫，辛亥革命期間，在革命黨人的勸進之下，程德全在蘇州宣布獨立，並擔任江蘇都督；南京臨時政府成立後，程德全出任內務總長，並與章炳麟合組統一黨、共和黨，但不久又退出。二次革命期間，程德全雖響應反袁，但又避居上海不出，後亦遭袁世凱免職，退出政界並投入佛門。1926年，程德全在常州天寧寺出家，法名寂照。1930年5月29日，程德全病逝於上海。遺著有《程中丞奏稿》、《撫吳文牘》等。